淡水河系因社會不斷進步，新事物與新思維不斷出現，淡水河系也出現不少問題。有些問題是全面性的，全河系支流都同時面對，甚至全台灣所有河流都面對。有些問題是個別性的，只發生在某一支流上，但重要性和指標性，往往不低於全面性的問題。
淡水河系是由新店溪、基隆河、大漢溪三條支流組成的，全河系共同的問題：每條河流的下游都變成大排水溝，而台北90%都是家庭廢水，污水下水道是建設時的首要之務。以下為淡水河系全面性的議題熱點：
1. 新店溪從中、永和到板橋，秀朗橋到華江橋，共有七個抽水 站，每個抽水站事實上就是都市大排水溝的出口，不同顏色的污水滾滾流出。坪林交流道曾因為是否要讓2000～4000輛車開放通行而吵得不可開交。而新店溪旁的新烏公路都同樣在水源保護區，公路與集合式的住宅，直接建在溪畔，相距零公尺，卻無人聞問。近年在新店溪畔的龜山、濛濛谷，因台北縣政府和新店市公所打著觀光的政策，造成新店溪因過度休憩使用，而不顧環境承受的能力。
2. 基隆河在基隆市的水源保護區往上移，讓人不禁要問：水源保護區內的土地多年來領了水源回饋金，但政府和人民做了多少保護的事情？是因水源污染了，乾脆把水源保護區往上移，然後再享受土地增值的紅利嗎？歷年環保署水質資料顯示，基隆河汐止以上水質屬中度污染，進入了台北市之後則變成了重度污染，台北市污水接管率號稱有八成，污染從何而來？主管單位沒有明確的答案。
3. 大漢溪被石門水庫及鳶山堰截流，鳶山堰以下除了三峽溪注入些自然水體之外，所有的水流都是污水。從石門水庫及鳶山堰有19km的天然河道，這段河道包含了大溪、三峽、八德、鶯歌，這幾個鄉鎮都沒有污水下水道，污水全都進了鳶山堰。另外大漢溪沿線拜北橫之賜，巴陵地區已千瘡百孔，而霞雲、羅浮地區現也急起直追。近年新竹縣政府及尖石鄉公所力推新竹後山，就是大漢溪上游的觀光旅遊。這些地區承載量有評估過嗎？這一片沒有管制的山林，是否會崩潰？是值得深思的問題。
4. 河川高灘地過去是以防洪為首要考量，現今則兼顧休閒。台北地區首開運用河川高灘地做為休閒綠地之區，使河道兩岸綿延幾十公里的河川高灘地，夾雜了水泥籃球場、溜冰場外，成為生態單調的人工草地。台北縣政府著手建設人工濕地，做為污水處理之用，多了些生態考量，其結果如何，有待全民的監督。由於公園、堤岸、道路、河流、高灘地等管理單位整合不良，廣大的河濱休閒草地，因堤岸圍牆之興建，無方便進入之處，花了大筆預算，使用率卻不高，應如何的改善，值得有關單位去思量。
5. 河川是垃圾堆積場，是台灣所有河流的命運。雖然陸續在改進之中，但瘡疤仍歷歷在目。
梁蔭民老師與公民記者
梁蔭民老師說明三腳渡位置
招募巡守志工
石門水庫壩頂
(資料提供：梁蔭民老師）
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