農委會特有生物研究保育中心2007年5月指出，台灣中油在桃園觀音沿海施行天然氣管線興建工程，已破壞有數千年歷史的藻礁。經環保署環評委員調查，要求中油應暫緩動工，民間同時發起搶救千年藻礁行動。經環保署於11月9日下午召開環評大會第158次會議，會中通過中油針對海底天然氣管線破壞桃園外海藻礁的因應對策，並且建議主管機關規劃藻礁保護區。
特有生物研究保育中心助理研究員劉靜榆指出，桃園縣觀音海岸的小飯壢溪口至新屋溪口間，寬達500公尺、長約4公里，是目前藻礁礁體最完整、最大的區域。
中油興建台中到桃園大潭的海底天然氣輸送管，施工路徑影響觀音外海的大片藻礁生態。此環評案早在2005年通過環評審查，當時並未發現施工位置附近的桃園外海，有全台面積最大的稀有藻礁，是在中油施工之後，才由行政院特有生物中心發現，故環保署以及相關單位立即要求中油停工，並提出因應對策報告。
環保署強調，儘管該案早通過環評，中油也修改施工內容，將坑道由20公尺寬縮為4公尺，但觀音海岸藻礁屬於珍貴生態地區，在藻礁地帶埋設天然氣管線，對於當地自然生態影響相當大。
民間也發起搶救藻礁行動，籲請政府儘速設藻礁保護區。「要形成觀音海岸綿延4公里的藻礁區，得花上數千年時間，中油直接在藻礁礁體上釘樁，造成礁體碎裂，要回復原狀已不可能。唯今之計是不要繼續傷害這塊珍貴的自然資產，並速設藻礁保護區。」發起搶救行動的觀音鄉保生村社區規畫師溫梅香說。
環保署日前召開環評大會第158次會議，會中通過中油針對海底天然氣管線破壞桃園外海藻礁的因應對策，中油同意盡力復育藻礁，不過因為國內缺乏藻礁復育專家，只能透過相關學者專家參與的方式來亡羊補牢。另外由於之前停工造成堆置的工程廢土被潮汐沖刷，覆蓋周圍藻礁，所以環評會同意中油復工將土石運離現場，以免造成更大傷害。
環評會也附帶決議建請主管機關規劃藻礁生態保護區，以免未來又有珍貴的藻礁遭到類似的傷害。
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